Proteinlerin, vücudumuzda neredeyse sonsuz çeşitlilikte görevler üstlenen moleküler düzeyde anlaşılması, hemen hemen tüm biyoloji için temeldir. Son yıllarda, AlphaFold ve RoseTTaFold gibi hesaplamalı modelleme teknikleri, pahalı laboratuvar tabanlı yöntemlerin yerini alarak binlerce araştırmacının çalışmalarını hızlandırdı.
AlphaFold'un Yenilikleri
AlphaFold 3, birden fazla molekülün aynı anda simüle edilmesine izin veriyor - örneğin, bir DNA zinciri, bazı DNA bağlayıcı moleküller ve belki de işleri renklendirmek için birkaç iyon. İşte belirli bir kombinasyon için elde edilen sonuç; DNA şeritleri ortadan yukarı doğru gidiyor, proteinler yan tarafta birikmiş durumda ve sanırım bunlar ortada küçük yumurtalar gibi yerleşmiş iyonlar.
Google DeepMind, ticari olmayan kullanım için modeli ücretsiz olarak kullanıma sunan AlphaFold Sunucusu adlı tamamen barındırılan bir web uygulaması sunuyor. Kullanımı ücretsiz ve oldukça kolay - ben de bunu, açıklarken başka bir pencerede yaptım (yukarıdaki resmi nasıl aldığım budur). Sadece bir Google hesabınıza ihtiyacınız var ve ardından istediğiniz kadar sıra ve kategoriyi besleyip gönderebilirsiniz; birkaç dakika içinde işiniz tamamlanmalı ve modelin o pozisyondaki konformasyon konusundaki güvenini temsil etmek için renklendirilmiş canlı bir 3D molekül alacaksınız.